不消说四个情同手饱读的乌龟少年从来生活在隐秘的下水道中，在师父（成龙 配音）的训练下，他们成为了身手高超的“忍者神龟”，渴顾念被人类接纳的四小只，在人类朋友艾普的赞助下，户口始追踪一个神秘的罪人集团，但随着一支强大变种生物军队的降临，相同属于变种生物的忍者神龟们知道，这下大麻烦来了……