尼奥（基努·里维斯 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 - 饰）重回矩阵：在这里，一个是矩阵透露出来，周而复始的遍及寰宇，另一个则是障翳其后，真实的人类世化工大学。为了弄领悟自身所处的“现实”究竟是真是假，尼奥不得不再次做出采取……