< >2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶权力试图袪除地球，大量外星人通过神秘传送门入腐蚀，将都邑化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍旧然不敌敌人攻势，死伤繁重。胸襟着忍者最强武器——希顾念，忍者神龟们顶多回到过去时空，找到户口启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复寰宇安详。莱昂纳多的高足凯西负担起这一使命，他在过去时空与女记者艾普奥尼尔成功接头，并和忍者神龟莱昂纳多、米户口朗基罗、拉斐尔、多纳泰罗汇合，户口启了救济寰宇的行动。“我们的未来，我们自身做主”，忍者神龟们向朗格提倡了终极挑战利眠宁