幕府时代末期，外忧内患，山河荡漾，百姓生活辛苦，且生命期间受到威故故协。少年心太因其慈悲纯碎之心酬报飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下训练剑法，更名剑心。 在国家危难之际，年轻的剑心怀揣迁移时代